Seqera

Seqera 是開源工作流程引擎 Nextflow 的開發團隊所成立的公司，官網數字是 Nextflow 每月執行超過 250 萬次、每天有 2 萬多名科學家在用、社群提供 140 多條開源流程。Seqera 平台把資料、流程、互動分析、AI 與運算整合在一起，涵蓋從資料匯入、分析到結果解讀的整個科學資料生命週期，所有分析都有版本控制、執行追蹤與稽核紀錄，資料留在你自己的基礎設施裡。

AI 的部分叫 Co-Scientist，可以從網頁介面、CLI 與 MCP 使用，官網說它涵蓋自助啟動流程、AI 輔助開發到 24 小時自主運作的代理。其他模組包括 Pipelines、Studios（容器化、可重現的互動分析環境，支援自訂工具與 SSH）、Containers，以及 Intelligent Compute（自動調整規格、Spot 中斷容錯、錯誤診斷與重試）。它可以部署在既有的地端系統，或 AWS、GCP、Azure 上，不需強制搬遷。

功能特色與適用場景：方案分為 Cloud Basic（免費，最多 3 位使用者、3 個同時執行、保留 250 次執行紀錄、100 個 vCPU）、Cloud Pro、Enterprise，以及給臨床與製造的 Validated 版本，支援 21 CFR Part 11 與 EU Annex 11 的 GxP 需求。運算依用量計費，CPU 每小時 0.10 美元。客戶案例列出 RNA-Seq 運算成本降 81%、臨床通量兩個月擴大 8 倍等。對台灣做基因體定序、精準醫療、農業基因研究的團隊，如果已經在用 Nextflow 或 nf-core 流程，Seqera 是很自然的下一步；需要地端或私有雲部署、GxP 驗證的醫院與藥廠則要走 Enterprise 或 Validated 方案。